Il rend difficile la détection de ses fichiers et modifie les droits des clés d'accès, selon Microsoft. Le ver est plus susceptible d'affecter les grands réseaux aux Etats Unis, Mexique, France, Espagne, Canada, ... Des ordinateurs infectés pourraient ne pas pouvoir accéder Windows Update, l'outil de mise à jour de Windows.

Microsoft propose de télécharger MSRT avec une machine « propre » puis de le distribuer sur le réseau. De nombreuses sociétés auraient vu Conficker se répandre rapidement sur leur réseau ces dernières semaines, selon Mikko Hypponen, chief research officer chez F-Secure. F-Secure a analyse le ver et trouvé qu'il contient un algorithme qui génère des noms de domaines pour des serveurs de commande et de contrôle.

Les hackers peuvent ensuite mettre en service ces noms de domaine comme un site Web où les PC infectés viendront se connecter afin de mettre à jour le code malveillant ou chercher des instructions. La technique a déjà été employée par d'autres botnets comme Mebroot. Il est très difficile de stopper ces sites Web de commande et de contrôle, car il est difficile lesquels vont être activés parmi les centaines de serveurs pouvant devenir menaçants.

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